孕酮低大多是由于女性黄体酮功能不全引起的，会导致黄体分泌不足引起孕酮低。此外，孕妇在怀孕期间没有注重休息，过度劳累或者不注重饮食，也可能导致孕酮低。孕酮低会导致阴道出血，腹痛等先兆流产等症状。因此，孕妇一旦出现孕酮低的问题，要及时到医院进行治疗，可以在医生指导下服用黄体酮药物或注射黄体酮来补充孕酮，同时注重休息。
体内孕激素是由卵巢，胎盘和肾上腺皮质产生。但孕酮主要由卵巢黄体分泌，孕酮的含量随月经周期性变化而波动。孕前期出现腹痛、阴道流血这些迹象时，可能孕激素、HCG水平低下，会有先兆流产迹象。黄体功能不足，孕妇在整个生理期，尤其是有月经周期提前、经期缩短的情况，提示着黄体功能不足孕激素水平自然也会相应下降。当有甲状腺功能低下，孕酮水平也会下降。这是孕酮降低的三个主要原因。
怀孕期孕酮值过低，最先考虑到黄体功能不足。次之，输卵管妊娠时孕酮值水准较为低，假如孕酮值水准超过73mmol/L，基础可清除输卵管妊娠。最后，孕期13周之内，孕酮值水准过低，怀孕初期流产风险性较为高，先兆性流产时，孕酮值若有降低发展趋势，有可能小产。造成孕酮值降低的缘故可能是试管胚胎本身发育不全。第三，怀孕期胚胎作用减低时，血中孕酮值水准降低。一次血细胞孕酮值水准低于5ng/ml，提醒为胎死腹中。
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