龋齿、磨耗等牙病引起的根尖周炎，牙菌斑和牙结石堆积引起的牙周炎，智齿萌出不全，盲袋不易清洁引起的智齿冠周炎，这些病变都会造成牙痛。
无论是根尖周还是牙周袋，或者智齿的盲袋，都是缺氧的环境，其中有大量的厌氧菌在繁殖活跃，毒力强，是引起口腔炎症的主要细菌。甲硝唑对厌氧菌有很好的抗菌作用，甲硝唑抗厌氧菌使用一个星期为一个疗程。
但是在口腔引起炎症的细菌中，除了厌氧菌以外，还有其他各种种类的细菌，这些细菌需要用广谱抗生素来杀灭，所以甲硝唑还需要配合广谱抗生素，才能取得很好的抗炎效果。
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