目前在临床上对于肠息肉无所谓最佳的治疗方法，主要是根据引起肠息肉的不同病因以及息肉的数目、大小，采用不同的治疗方式。
一般如果是因为细菌性肠炎所引起的单发、比较微小的息肉，可以通过控制肠炎症状，而无需手术治疗，就可以获得症状的缓解与治愈。
如果是自身免疫性肠病所引起的息肉，通常需要采用美沙拉嗪控制肠炎症状，并且并且复诊，警惕恶变。
如果是其它原因引起的肿瘤性息肉，直径超过一公分以上时，通常需要及时的手术切除，并送病理检查，排除恶变可能，证实恶变时，通常需要加做肠癌根治手术治疗。
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